Gut microbiota of monogastric livestock study
Recherche Santé et productions animales

Évaluation de la variabilité du microbiote chez les monogastriques : un outil au service de vos projets

03/04/2025

Le microbiote, ensemble complexe de micro-organismes présent dans plusieurs localisations du corps et notamment au niveau intestinal, joue un rôle fondamental dans la santé et le bien-être des animaux. Il influence directement la digestion, l’immunité, et même le comportement des animaux. Comprendre et exploiter cette diversité microbienne est devenu un enjeu majeur pour améliorer les pratiques d’élevage et la santé animale.

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Lors de notre Rencontre sur le microbiote du 20 mars, Jérôme Le Douce, chargé de recherche clinique chez INNOZH, a présenté les travaux d’INNOZH sur les méthodes et outils dédiés à l’évaluation du microbiote chez les monogastriques.

L’analyse du microbiote est aujourd’hui largement intégrée dans les recherches menées par INNOZH visant à évaluer l’efficacité de solutions innovantes sur l’amélioration de la santé et les performances des animaux. La méthode et les outils présentés combinent l’expertise pluridisciplinaire d’INNOZH, alliant compétences vétérinaires, santé animale, et production animale, permettant de mettre en lumière l’importance du microbiote, son développement et sa résilience, afin d’apporter des réponses complémentaires sur l’impact des solutions testées.

Expertise et Innovation en Microbiote

INNOZH se distingue par son approche intégrée, alliant expertise scientifique et applications pratiques. Les recherches menées par l’équipe visent à comprendre et à exploiter la variabilité du microbiote pour améliorer la santé et le bien-être des animaux de rente.

 

Méthodologie et Processus

Les travaux d’INNOZH reposent sur une méthodologie rigoureuse, incluant des prélèvements précis sur le terrain et des analyses avancées avec des laboratoires partenaires. « Les échantillons, prélevés sur diverses espèces (porcs, volailles, etc.), sont analysés pour identifier les populations bactériennes et leurs interactions. Cette approche permet de tester des solutions ciblées, telles que des probiotiques et des compléments alimentaires, adaptées aux besoins spécifiques de chaque espèce », explique Jérôme Le Douce.

Expertise Statistique

L’expertise statistique d’INNOZH joue un rôle crucial dans l’interprétation des données complexes issues des analyses de microbiote. Jérome le Douce poursuit : « Grâce à des techniques avancées d’analyse de données, l’équipe est capable de détecter des tendances et des corrélations significatives, permettant ainsi de formuler des recommandations précises pour les entreprises partenaires et sponsor du projet ».

Rencontre Microbiote_2025.03.20_INNOZH SPA

Création d'une Base de Données Métabolomique

« Pour enrichir nos capacités d’analyse, nous développons une base de données métabolomique. Cette base permettra de prédire et d’identifier des biomarqueurs spécifiques et d’évaluer l’impact des différentes solutions sur le microbiote et les métabolites produits par celui-ci. Elle constitue un outil précieux pour le diagnostic précis et l’optimisation des stratégies nutritionnelles et thérapeutiques » poursuit Jérôme Le Douce.

 

traitement antibiotique poulet de chair

Objectif : Constituer une base de métabolites produits par le microbiote.

Bénéfices :

  • Diagnostic précis : Permet d’identifier des biomarqueurs spécifiques pour un diagnostic plus précis et rapide.
  • Optimisation des solutions : Aide à tester et à optimiser les solutions en évaluant leur impact sur le microbiote.
  • Innovation : Facilite le développement de nouvelles approches thérapeutiques et nutritives basées sur le microbiote.
  • Réduction des coûts : Réduit le besoin de tests coûteux et chronophages grâce à une base de données complète et fiable.

Applications et Résultats en élevage avicole

Cas d’étude volaille

INNOZH explore l’impact des traitements antibiotiques sur le microbiote des volailles. Les résultats montrent des différences significatives dans la diversité microbienne entre les groupes traités et non traités, ouvrant la voie à des pratiques d’élevage plus durables et efficaces.

Les prélèvements effectués dans les élevages incluent des échantillons de fèces et de portions intestinales. Ces échantillons sont analysés pour évaluer l’impact des solutions testées sur le microbiote, en identifiant les souches pathogènes et en quantifiant les populations bactériennes. Les résultats permettent d’optimiser les pratiques d’élevage et de développer des solutions thérapeutiques innovantes.

 

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SOURCES

LE DOUCE, J. (2025). Évaluation de la variabilité du microbiote chez les monogastriques : un outil au service de vos projets. Rencontre Scientifique & Technique sur le microbiote, Ploufragan, France.

 INNOZH. (2020, 15 septembre). Exploiter l’analyse du microbiote animal : de l’hypothèse d’étude à l’interprétation des résultats [Webinaire]. Présenté avec Labofarm à l’occasion du Salon SPACE. https://www.youtube.com/watch?v=jI20gVCSqNI&t=1s

Pour aller plus loin …

Microbiote des Animaux de Compagnie (Chien/Chat)

Le microbiote joue un rôle crucial dans la santé digestive et buccale de nos animaux de compagnie. INNOZH a engagé des recherches sur le microbiote des chiens pour explorer comment des régimes alimentaires adaptés impactent positivement leur microbiote et in fine influencer leur bien-être.

Nos recherches actuelles se concentrent sur l’évaluation de l’impact de différentes rations alimentaires sur la santé buccale des chiens. Une étude en cours, dont les résultats seront présentés lors de la Rencontre Petfood le 19 juin 2025, démontre que des recommandations nutritionnelles personnalisées peuvent significativement améliorer la santé de nos compagnons à quatre pattes.

Ces travaux mettent en lumière l’importance d’une approche individualisée pour optimiser le bien-être des animaux de compagnie. En comprenant et en exploitant la diversité du microbiote, nous pouvons offrir des solutions innovantes pour une vie plus saine et plus heureuse pour nos chiens et chats.

chien vétérinaire étude du microbiote

 Evaluating Microbiota Variability in Monogastrics: A Tool for Your Projects

The microbiota, a complex ensemble of microorganisms present in various body locations, particularly the intestines, plays a fundamental role in animal health and well-being. It directly influences digestion, immunity, and even animal behavior. Understanding and leveraging this microbial diversity has become a major challenge in improving livestock practices and animal health.

During our Microbiota Meeting on March 20, Jérôme Le Douce, Clinical Research Manager at INNOZH, presented INNOZH’s work on methods and tools dedicated to evaluating microbiota in monogastrics.

Microbiota analysis is now widely integrated into INNOZH’s research aimed at assessing the effectiveness of innovative solutions in improving animal health and performance. The presented method and tools combine INNOZH’s multidisciplinary expertise, merging veterinary skills, animal health, and animal production, to highlight the importance of microbiota, its development, and resilience, providing complementary insights into the impact of tested solutions.

Expertise and Innovation in Microbiota: INNOZH stands out with its integrated approach, combining scientific expertise and practical applications. The team’s research aims to understand and exploit microbiota variability to enhance the health and well-being of livestock animals.

Methodology and Process: INNOZH’s work relies on rigorous methodology, including precise field sampling and advanced analyses with partner laboratories. « Samples, collected from various species (pigs, poultry, etc.), are analyzed to identify bacterial populations and their interactions. This approach allows testing targeted solutions, such as probiotics and dietary supplements, tailored to the specific needs of each species, » explains Jérôme Le Douce.

Statistical Expertise: INNOZH’s statistical expertise is crucial in interpreting complex microbiota analysis data. Jérôme Le Douce continues: « Using advanced data analysis techniques, the team can detect significant trends and correlations, enabling precise recommendations for partner companies and project sponsors. »

Creation of a Metabolomic Database: « To enhance our analytical capabilities, we are developing a metabolomic database. This database will predict and identify specific biomarkers and evaluate the impact of various solutions on microbiota and the metabolites it produces. It is a valuable tool for precise diagnosis and optimizing nutritional and therapeutic strategies, » Jérôme Le Douce adds.

Applications and Results in Poultry Farming: INNOZH explores the impact of antibiotic treatments on poultry microbiota. The results show significant differences in microbial diversity between treated and untreated groups, paving the way for more sustainable and effective farming practices. Samples collected from farms include feces and intestinal portions. These samples are analyzed to assess the impact of tested solutions on microbiota, identifying pathogenic strains and quantifying bacterial populations. The results help optimize farming practices and develop innovative therapeutic solutions.

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Santé et productions animales Recherche
03/04/2025

Évaluation de la variabilité du microbiote chez les monogastriques

Le microbiote, ensemble complexe de micro-organismes présent dans plusieurs localisations du corps et notamment au niveau intestinal, joue un rôle fondamental dans la santé et le bien-être des animaux. Il influence directement la digestion, l’immunité, et même le comportement des animaux. Comprendre et exploiter cette diversité microbienne est devenu un enjeu majeur pour améliorer les pratiques d’élevage et la santé animale.  English Summary Below
Santé et productions animales Rencontres Scientifique & Technique
03/05/2024

Enterococcus Cecorum : Évolutions & perspectives en élevage avicole

Rendez-vous jeudi 20 juin 2024, pour une Rencontre Scientifique et Technique sur le thème : « Enterococcus Cecorum : Évolutions & perspectives en élevage avicole » Cette rencontre se focalisera sur l’état de la recherche, les impacts et la gestion au quotidien , les problématiques d’antibiorésistance et la recherche de solutions alternatives au travers de conférences d’experts et d’interventions d’entreprises. Mettez en lumière vos projets ! Si vous disposez d’un sujet ou d’un produit d’actualité lié à l’innovation dans le secteur de l’alimentation animale, n’hésitez pas à prendre contact avec Claudie Le Meur Bourdon afin d’engager une discussion à ce sujet et le mettre en lumière.

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La formation professionnelle continue joue un rôle crucial dans le développement des compétences et l’innovation dans le domaine de la santé animale. En particulier, l’étude du microbiote, cet ensemble complexe de micro-organismes vivant dans et sur les animaux, est devenue une priorité pour les chercheurs et les praticiens. Comprendre le microbiote et son impact sur la santé animale ouvre de nouvelles perspectives pour améliorer les pratiques vétérinaires, les traitements et la prévention des maladies.
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Dossier microbiote : un monde invisible au cœur de la santé animale

Le microbiote intestinal, cet écosystème invisible mais essentiel, est aujourd’hui au centre des recherches en santé animale. Composé de milliards de micro-organismes, il joue un rôle clé dans la digestion, le métabolisme et la réponse immunitaire des animaux. Mieux comprendre son fonctionnement ouvre de nouvelles perspectives pour améliorer le bien-être animal, optimiser les performances d’élevage et développer des solutions de santé innovantes.  English Summary Below
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